مقایسه روش انتخاب ژنومی و کلاسیک در اصلاح نژاد طیور بومی ایران

Authors

  • احمد رضا شریفی گروه علوم دامی دانشگاه گوتینگن آلمان
Abstract:

زمینه مطالعاتی: در کشورهای در حال توسعه مخصوصا" ایران سرمایه­های بومی نقش مهمی در اقتصاد روستایی ایفا می­کنند. نژادهای بومی در مقایسه با سویه­های تجاری می­توانند سطوح بالاتری از عملکرد را در شرایط نامساعد محیطی حفظ ­کنند. هدف: این مطالعه به منظورمقایسه راهکارهای انتخاب ژنومی و انتخاب کلاسیک در طیور بومی ایران با استفاده از نرم­افزار ZPLAN+ انجام شد. روش کار:  یک سناریوی مرجع و یک سناریوی ژنومی با تعداد 3460 پرنده در هر دو سناریو شبیه­سازی شد.  سناریوی مرجع بر پایه اطلاعات فنوتیپی و سناریوی ژنومی بر پایه ترکیبی از اطلاعات فنوتیپی و ژنومی با دو جمعیت مرجع 500 و 1000 حیوان برای هر دو جنسشبیه­سازی  شد. اطلاعات ژنومی مربوط به 4000 مرغ و تعداد متغیر خروس (800 تا 4000) بود. صفات مورد مطالعه شامل تعداد تخم­مرغ، وزن بدن در هشت هفتگی، متوسط وزن تخم­مرغ و سن بلوغ جنسی بود. برای شبیه­سازی این صفات از پارامترهای انحراف­معیار فنوتیپی، وراثت­پذیری، همبستگی­های ژنتیکی و فنوتیپی و ضرایب اقتصادی استفاده شد. نتایج: فاصله بین­نسلی در هر دو سناریو برابر 5/14 ماه بود. با افزودن اطلاعات ژنومی به سناریوی مرجع دقت برآوردها از 62/0 برای خروس­ها و 64/0 برای مرغ­ها به 77/0 برای هر دو جنس در سناریوی ژنومی افزایش یافت. رشد ژنتیکی صفات با افزایش تعداد خروس­های تعیین ژنوتیپ شده و همچنین با افزایش تعداد پرنده در جمعیت مرجع افزایش یافت. مقادیر رشد ژنتیکی صفت تعداد تخم­مرغ، وزن بدن در هشت هفتگی، متوسط وزن تخم­مرغ و سن بلوغ جنسی به ترتیب از 22/0، 57/2، 09/0 و 23/0- در سناریوی مرجع به 30/0، 60/3، 11/0 و 27/0- درسناریوی ژنومی با جمعیت مرجع 1000 حیوان  افزایش یافت. سود حاصل از برنامه اصلاحی تنها در سناریوی ژنومی با جمعیت مرجع 1000 پرنده نسبت به سناریوی مرجع بالاتر بود.  نتیجه­گیری نهایی: استفاده از اطلاعات ژنومی باعث افزایش رشد ژنتیکی در تمام صفات شد. در این تحقیق هزینه­ها کاهش نیافتند اما اطلاعات ژنومی دقت انتخاب برنامه اصلاح نژادی را افزایش داد.   

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

کارایی انتخاب ژنومی در برنامه‌های اصلاح نژاد مرغان بومی

The development of genomic selection has created new strategies in animal breeding programs. The aim of this study was to investigate the efficiency of genomic selection in breeding programs of native hens. In this study, a reference scenario with 3380 birds using pedigree and phenotypic information was simulated and the expected genetic progress was derived deterministically with the software ...

full text

کاوش ژنومی نشانه های انتخاب در گاوهای بومی نژاد سرابی و تالشی ایران

The aim of this study was to find the footprint of selection in native Sarabi and Taleshi cattle breeds 296 cattle from two breeds were sampled and genotyped. by 40 k microarray of illumine company. 43 animals were removed because their ACR was below 0.09. Markers were filtered with minor allele frequency (MAF) equal 0.01 and Hardy-Weinberg equilibrium test (10-6). After filtering, 28782 marker...

full text

مقایسه روش های مختلف آماری در انتخاب ژنومی گاوهای هلشتاین

Genomic selection combines statistical methods with genomic data to predict genetic values for complex traits.  The accuracy of prediction of genetic values ​​in selected population has a great effect on the success of this selection method. Accuracy of genomic prediction is highly dependent on the statistical model used to estimate marker effects in reference population. Various factors such a...

full text

کاوش ژنومی برای ردیابی نشانه‌های انتخاب در اسب نژاد ترکمن

Abstract Selection not only increases the frequency of new-useful mutations but also remains some signals throughout the genome. Since these areas are often control economically important traits, identifying and tracking these areas is the most important issue in the animal genetics. The aim of this study was to detecting signals of selection in the genome of Turkmen horse using 70K SNP chip...

full text

مقایسه روش های مختلف آماری در انتخاب ژنومی گاوهای هلشتاین

انتخاب ژنومی، ارزش­های ژنتیکی را در صفات پیچیده کمی از طریق ترکیب داده­های ژنومی و فنوتیپی با استفاده از مدل­های آماری پیش­بینی می­کند. صحت پیش­بینی ارزش­های ژنتیکی در جمعیت تحت انتخاب اثر زیادی بر موفقیت این روش انتخاب دارد. مدل آماری که برای برآورد اثرات نشان­گری در جمعیت مرجع از آن استفاده می­شود، از عوامل مؤثر بر صحت پیش­بینی­ها می­باشد. عوامل مختلفی مانند تراکم نشان­گری، جمعیت مرجع و معمار...

full text

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}


Journal title

volume 27  issue 3

pages  201- 212

publication date 2017-11-22

By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023