مقایسه روش انتخاب ژنومی و کلاسیک در اصلاح نژاد طیور بومی ایران
Authors
Abstract:
زمینه مطالعاتی: در کشورهای در حال توسعه مخصوصا" ایران سرمایههای بومی نقش مهمی در اقتصاد روستایی ایفا میکنند. نژادهای بومی در مقایسه با سویههای تجاری میتوانند سطوح بالاتری از عملکرد را در شرایط نامساعد محیطی حفظ کنند. هدف: این مطالعه به منظورمقایسه راهکارهای انتخاب ژنومی و انتخاب کلاسیک در طیور بومی ایران با استفاده از نرمافزار ZPLAN+ انجام شد. روش کار: یک سناریوی مرجع و یک سناریوی ژنومی با تعداد 3460 پرنده در هر دو سناریو شبیهسازی شد. سناریوی مرجع بر پایه اطلاعات فنوتیپی و سناریوی ژنومی بر پایه ترکیبی از اطلاعات فنوتیپی و ژنومی با دو جمعیت مرجع 500 و 1000 حیوان برای هر دو جنسشبیهسازی شد. اطلاعات ژنومی مربوط به 4000 مرغ و تعداد متغیر خروس (800 تا 4000) بود. صفات مورد مطالعه شامل تعداد تخممرغ، وزن بدن در هشت هفتگی، متوسط وزن تخممرغ و سن بلوغ جنسی بود. برای شبیهسازی این صفات از پارامترهای انحرافمعیار فنوتیپی، وراثتپذیری، همبستگیهای ژنتیکی و فنوتیپی و ضرایب اقتصادی استفاده شد. نتایج: فاصله بیننسلی در هر دو سناریو برابر 5/14 ماه بود. با افزودن اطلاعات ژنومی به سناریوی مرجع دقت برآوردها از 62/0 برای خروسها و 64/0 برای مرغها به 77/0 برای هر دو جنس در سناریوی ژنومی افزایش یافت. رشد ژنتیکی صفات با افزایش تعداد خروسهای تعیین ژنوتیپ شده و همچنین با افزایش تعداد پرنده در جمعیت مرجع افزایش یافت. مقادیر رشد ژنتیکی صفت تعداد تخممرغ، وزن بدن در هشت هفتگی، متوسط وزن تخممرغ و سن بلوغ جنسی به ترتیب از 22/0، 57/2، 09/0 و 23/0- در سناریوی مرجع به 30/0، 60/3، 11/0 و 27/0- درسناریوی ژنومی با جمعیت مرجع 1000 حیوان افزایش یافت. سود حاصل از برنامه اصلاحی تنها در سناریوی ژنومی با جمعیت مرجع 1000 پرنده نسبت به سناریوی مرجع بالاتر بود. نتیجهگیری نهایی: استفاده از اطلاعات ژنومی باعث افزایش رشد ژنتیکی در تمام صفات شد. در این تحقیق هزینهها کاهش نیافتند اما اطلاعات ژنومی دقت انتخاب برنامه اصلاح نژادی را افزایش داد.
similar resources
کارایی انتخاب ژنومی در برنامههای اصلاح نژاد مرغان بومی
The development of genomic selection has created new strategies in animal breeding programs. The aim of this study was to investigate the efficiency of genomic selection in breeding programs of native hens. In this study, a reference scenario with 3380 birds using pedigree and phenotypic information was simulated and the expected genetic progress was derived deterministically with the software ...
full textکاوش ژنومی نشانه های انتخاب در گاوهای بومی نژاد سرابی و تالشی ایران
The aim of this study was to find the footprint of selection in native Sarabi and Taleshi cattle breeds 296 cattle from two breeds were sampled and genotyped. by 40 k microarray of illumine company. 43 animals were removed because their ACR was below 0.09. Markers were filtered with minor allele frequency (MAF) equal 0.01 and Hardy-Weinberg equilibrium test (10-6). After filtering, 28782 marker...
full textمقایسه روش های مختلف آماری در انتخاب ژنومی گاوهای هلشتاین
Genomic selection combines statistical methods with genomic data to predict genetic values for complex traits. The accuracy of prediction of genetic values in selected population has a great effect on the success of this selection method. Accuracy of genomic prediction is highly dependent on the statistical model used to estimate marker effects in reference population. Various factors such a...
full textکاوش ژنومی برای ردیابی نشانههای انتخاب در اسب نژاد ترکمن
Abstract Selection not only increases the frequency of new-useful mutations but also remains some signals throughout the genome. Since these areas are often control economically important traits, identifying and tracking these areas is the most important issue in the animal genetics. The aim of this study was to detecting signals of selection in the genome of Turkmen horse using 70K SNP chip...
full textمقایسه روش های مختلف آماری در انتخاب ژنومی گاوهای هلشتاین
انتخاب ژنومی، ارزشهای ژنتیکی را در صفات پیچیده کمی از طریق ترکیب دادههای ژنومی و فنوتیپی با استفاده از مدلهای آماری پیشبینی میکند. صحت پیشبینی ارزشهای ژنتیکی در جمعیت تحت انتخاب اثر زیادی بر موفقیت این روش انتخاب دارد. مدل آماری که برای برآورد اثرات نشانگری در جمعیت مرجع از آن استفاده میشود، از عوامل مؤثر بر صحت پیشبینیها میباشد. عوامل مختلفی مانند تراکم نشانگری، جمعیت مرجع و معمار...
full textMy Resources
Journal title
volume 27 issue 3
pages 201- 212
publication date 2017-11-22
By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.
Keywords
Hosted on Doprax cloud platform doprax.com
copyright © 2015-2023